証明写真の修正や補正はしても大丈夫？

　大丈夫です。
スタジオで肌や輪郭を修正してくれるオプションもありますし、データで貰ってアプリなどで加工することもできますね。
しかし、注意しなければいけないのは「し過ぎてはいけない」ということです。写真が採用・不採用を決めることはなくても、「面接で会ってみたら全然違う！」ということが面接官の心理にどう働くかは分かりません。スタジオで頼む場合は任せても良いでしょうが、自分で修正する場合は、加減を間違えないようにしましょう。